粤港两地车牌批文卡过期后可以按以下步骤进行处理：

了解逾期情况

确认过期时长：明确批文卡过期的具体时长，因为不同时长的处理方式和难度可能有所不同，如刚过期不久可能相对容易处理，而长期过期则可能面临更复杂的手续和处罚。

检查车辆违章记录：在处理批文卡过期问题前，需先处理完车辆在内地和香港的所有违章记录。

准备申请材料

基本材料：《粤港澳机动车往来及驾驶人驾车申请书》《粤港澳机动车辆往来及驾驶员驾车批准通知书》（内地承办单位联）、车辆行驶证、司机驾驶证等。

补充材料：根据具体情况，可能还需提供公司的纳税证明、营业执照副本、商业登记证等，以证明企业或个人符合延期条件。

办理延期手续

选择办理方式：

网上办理：登录广东省公安厅交通管理局政务服务网，进入相应的车牌延期申请页面，按照系统提示填写申请信息，上传准备好的材料扫描件或照片。如果选择双向速递服务，需将《粤港澳机动车辆往来及驾驶员驾车批准通知书》（内地承办单位联）交由邮政 EMS 服务人员递交广东省公安厅交管局车辆管理所；如果不选择双向速递服务，需提供政务服务网上打印的受理回执。

现场办理：前往广东省公安厅交通管理局办证大厅，填写申请表并提交材料，可在车辆管理所 IC 卡自助办理业务柜员机申请延期，需提供 IC 卡自助办理业务柜员机打印的受理回执。

审核与缴费：提交申请后，相关部门会对材料进行审核。如申请材料存在问题，交通管理部门将通过电话或短信方式通知申请人补充或修改材料。审核通过后，申请人需按照通知要求进行缴费。

完成备案手续

办理成功后，申请人需持批文卡到备案地海关、边检部门办理备案手续。